我院研发“莲基因组数据库”获计算机软件著作权-新优技术-武汉市园林科学研究院

　　近日，从国家版权局获悉，由武汉市园林科学研究院莲属植物课题组（课题负责人：杨星宇博士）牵头研发的“莲基因组数据库（NGD）”成功获得一项计算机软件著作权（合作单位：中科院武汉植物园--水生植物生物地理学学科组）。
　　该数据库网络服务平台（NGD）提供了莲最新的基因组组装和注释（http://nelumbo.biocloud.net/home），目前收录了部分荷花品种（88个）表型性状数据，部署了包括Blast，Blat和Primer在内的多种生信应用程序，方便用户可以通过NGD执行序列分析、基因组变异查找与可视化、高度共表达基因网络构建和可视化、品种性状查询等，NGD借助不同数据库中的全面注释，有助于用户轻松检索相关功能的基因集（基因家族和转录因子）。同时NGD作为一个开源的在线免费数据库，具有数据丰富，功能齐全，操作容易等特点，对于莲种群基因组学和分子育种的研究非常有价值，数据库也会根据最新的研究进展定期更新莲基因产物的功能信息。通过对栽培莲和野生莲基因组进行遗传变异分析，我们希望能从基因组水平上解析不同栽培和野生莲基因组序列的遗传变异情况，以利于培育高产、优质新品种，提高育种技术和水平，深入挖掘莲的重要园艺及农艺性状基因，促进分子育种改良等等。该研究将有助于全面地了解莲全基因组的遗传变异特征，种群结构和系统进化分析结果也可以从全基因水平上追溯了解其栽培驯化历史。
　　在学术界，目前全球还未有相关研究机构组建“莲属植物基因组数据库”，我们研发的此数据库为第一个。就该数据库研发与分析，我们已联合向国际知名学术出版公司，《Nature》出版集团创办的国际权威期刊《Scientific Data》投稿一篇学术论文（该期刊2019年影响因子为5.93）——Nelumbo Genome Database: an integrative resource for gene expression and variants of Nelumbo nucifera (lotus)，目前论文已收到审稿回复，修改后有望正式发表，相关基因组数据会上传至全球通用的NCBI数据平台，对全球学术用途（非商业）公开，届时全球研究莲属植物的专家学者即可获知我们这项首创工作，并应用该数据库开展科学研究与合作。2019年本数据库组建完成并网络上线时，已列为“科技创新”类简报，由武汉市园林和林业局报送武汉市人民政府办公厅（2019.12.18.武汉市第240期“政务要情”简报）。国内《园林科技》期刊（2020年第2期，总第156期）也在行业内报道了我院这项数据库研究工作（第47页科技动态专栏）。
运行硬件环境：CPU：1.0GHz及以上；内存：1GB及以上；硬盘空间：无限制。
运行软件环境：操作系统：Windows或IOS；操作系统版本：无限制。
编程语言：Java.